El CIBERSAM cuenta con seis líneas de actuación fundamentales:

1 - Desarrollar, coordinar y potenciar la investigación en red entre los grupos de investigación integrantes

2 - Transferir de manera rápida los resultados generados por la investigación a la práctica clínica

3 - Transmitir los resultados alcanzados a la sociedad, a la comunidad científica y al sector empresarial

4 - Realizar una labor activa de divulgación y de participación en actividades docentes con contenido social

5 - Ejercer una labor de formación de calidad y desarrollar un Máster de Investigación en Salud  Mental

6 - Asesorar a las autoridades sanitarias en las tareas de planificación de la investigación y en las técnicas de inversión estratégica y de prevención.